José Amedo i Michel Domínguez van ser detinguts el 1988 i condemnats el 1991 per l'Audiència Nacional a 108 anys de presó per sis assassinats frustrats i un delicte d'associació de malfactors. Set anys més tard, el 1998, Domínguez va ser novament jutjat pel Tribunal Suprem i en aquesta ocasió en companyia de l'exministre de l'Interior José Barrionuevo i l'exdirector de la Seguretat de l'Estat Julián Sancristóbal. La condemna de Michel Domínguez per aquesta segona acció dels GAL va ser de dos anys i quatre mesos per detenció il·legal del ciutadà francès Segundo Marey. L'ex inspector de Policia, després d'una acumulació de condemnes, va sortir de manera definitiva de la presó l'any 2000.
Al setembre de 2011 Michel Domínguez va ser condemnat per l'Audiència Provincial de Madrid a reintegrar a les arques públiques 97.922 euros en concepte de responsabilitat civil pel cas dels maletins. Aquests fets van ser jutjats el 2007 i la sentència recollia que Rafael Vera, exsecretari d'Estat d'Interior, va lliurar 1,5 milions d'euros a les dones de José Amedo i Michel Domínguez "per garantir el silenci dels policies".